Xu Wang(王旭)
个人简介
在我本科阶段的学习中,我计划按照三个阶段与两条主线进行推进。即假期三个阶段:国内顶尖高校暑校、国内头部企业实习和境外高校暑研的三个阶段推进,努力丰富自己的社会见解,并锻炼个人的认知能力。在学期内两条主线:即在吉林大学本科生课程学习和清华钱班的科研训练(ESRT,ORIC)这两个方面达到学与用的深度融合
研究经历
我的研究兴趣包括:
图神经网络与知识图谱
生物信息学与数学建模
机器学习与启发式算法
抗体蛋白设计与大语言模型
在审中
Wang,X., Wang,C.*, Zhang,H., et.al. "Segmented parabolic adjustment of the FAST reflector based on spatial coordinate rotation transformation".iScience (SCI; First author)
Wang,Xu.*, He Rui, Tan Zihao., et.al. Prediction of the evolution of neo-coronavirus spike proteins based on Alpha Fold reconstruction. BioScience (SCI; First author)
已出版
Xu Wang*, Zijin Luo, Rui He, Yixin Shao(2023)"Novel Medical Question and Answer System: Graph Convolutional Neural Network Based with Knowledge Graph Optimization",Expert Systems with Applications,120211,ISSN 0957-4174, doi.org/10.1016/j.eswa.2023.120211 (SCI; First author) JCR1 top [pdf]
Wang, X.* (2022). "The analysis and re-optimization of food systems by using intelligent optimization algorithms and machine learning." All Life, 15(1), 656-677.doi.org/10.1080/26895293.2022.2079732 (SCI; First author) JCR Q4 [pdf]
Wang, X.*, Zhang, H., Liu, Z., He, R., & Wang, Z. (2021). "Intelligent Medical System of Unmanned Pharmacy Based on Internet Plus." In 2021 International Conference on Networking, Communications and Information Technology (NetCIT) (87-91). IEEE. (EI;First author)[pdf]
Note: *通讯作者
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学术参与
Reviewer
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科研项目
中国科学院大学生科创计划(第一负责人), 2021.06-2022.06
主要内容:结合专家系统、图神经网络和知识图谱技术,提出结合半监督图神经网络和知识图谱的疾病指导模型。通过MASR语音识别模块结合门控卷积单元对不同类型的语音进行有效文本处理,然后利用自然语言处理中的LTP模块对问句进行语义分析和分割匹配,并将关键词与疾病数量相结合,划分构造出具有知识图的集合节点。
关键词:图神经网络; 医疗知识图谱
投稿至:Expert Systems With Applications期刊已接收(JCR一区 中科院一区TOP) 第一作者 指导老师:崔喆教授(中科院成计所)
大学生创新创业训练计划(国家级项目;第一负责人;第一优秀结项), 2022.05-2023.06
主要内容:基于 Alpha Fold 重构的新冠病毒表面蛋白的演化预测:利用深度突变扫描对已有新冠病毒S表面蛋白进行突变,利用Alpha Fold对碱基序列进行三维蛋白重构后,以突变蛋白与人受体ACE2蛋白为适应度指标,构建基因组适应度景观进行全局差分进化,同时结合酵母双杂和SPR测量的实验手段对预测模型进行检验优化。
关键词:深度突变扫描;适应度景观;Alpha Fold;蛋白质亲和力
BioScience在投中 (一审 中科院一区 JCR 一区) 指导老师:孙晓颖教授,王林聪教授(吉林大学)
国际基因工程竞赛(iGEM, International Genetically Engineered Machine competition), 国际金牌 2022.3-2022.11
研究经历1:复合粮食系统评价预测模型, 2021.09-2022.04
主要内容:开发了人口、耕地和粮食系统的多变量评价系统,建立评价指标和发展预测模型,并通过高斯过程回归和神经网络建立不同规模的食品系统的预测模型。利用薄板插值法拟合了发展变化的三维曲面,最后通过群智能优化的方式来寻找变化后的平衡点和关键点。
关键词:多重回归分析;耦合度评价模型;群智能优化算法;神经网络
投稿至:ALL Life期刊(JCR四区 中科院四区) 已接收 独立一作
研究经历2:射电望远镜反射面调节与优化模型,钱班ESRT 2021.10-2023.01
提出针对FAST的分段抛物面的优化模型。采用粗细网格遍历可行方案,记录主缆节点在不同角度的最佳调整方案及相应执行器坐标和伸缩长度,建立反向传播模型,并利用几何模拟和蒙特卡洛试验相结合的方式验证。相较于传统的调节模型,本研究中分段解理想化抛物面在300米孔径的工作区域内将原始反射效率从77.92%提高到93.36%
关键词:反射面调整;空间坐标旋转变换;蒙特卡洛测试;反向传播算法
投稿至:iScience 期刊(JCR 一区 中科院二区) 在投(二审) 第一作者 指导老师:王成副教授(吉林大学)
教育经历
本科: 吉林大学 通信工程学院--信息工程专业 , 2020.09-2024.06
联培: 清华钱班-零一学院 , 2021.06-2024.06
暑研: 香港大学 , HKU(Li Ka Shing)Faculty of Medicine---Research Assistant 2023.06-2023.09
研究生: 清华大学-北京大学生命联合中心,北大叉院 +清华生科 直博PhD 2024.09-202x.xx(蹲毕业)
竞赛荣誉
吉林省全国大学生数学建模竞赛一等奖, 2021.09
吉林省全国大学生数学竞赛(非数学类)二等奖, 2021.11
全国大学生生命科学竞赛(2022,创新创业类)全国二等奖 (团队负责人), 2022.08
全国大学生生命科学竞赛(2023,创新创业类)全国二等奖 , 2023.08
国际基因工程竞赛(iGEM)2022 赛季 国际金奖 (吉大JLU_China 队长), 2022.10
国际基因工程竞赛(iGEM)2023 赛季 北京理工大学(BIT_China)队伍 Advisor 国际金牌, 2023.10
国际基因工程竞赛(iGEM)2023 赛季 海南大学(Hainan_U)队伍 Advisor 国际金牌 2023.10
国际基因工程竞赛(iGEM)2023 赛季 华大基因(BGI)队伍 Instructor 国际金牌 2023.10
第八届中国 “互联网+”大学生创新创业全国铜奖, 2022.12
研学经历
清华大学钱学森力学班暨深圳零一学院 — 零一学者(长期培养) 2021.06-2024.06
北京大学前沿交叉学科研究中心夏令营 2021.06
清华大学结构生物学夏令营 2021.07
南洋理工大学商业人工智能实验室实习 (Ad: Prof. Teoh Teik Toe) 2022.01-2022.02
牛津大学机器学习暑期班 OxML2022 2022.07-2022.08
NASA/BMSIS YSP 暑研(Young Scientist Program) 2022.07-2022.09
吉林大学“新生杯”辩论赛决赛最佳辩手
吉林大学南湖校社联组织部部长/生管会分管主席
吉林大学华为校园开发者/CTF Spirit网安校队成员
吉林大学本科生“筑梦·远航”高水平学科竞赛成果奖(最高A类 单笔5w,每年度全校 评选2个)
吉林大学本科生“创新创业(力旺)精英学生” 奖学金(单笔2w,每年度全校本硕博共 评选2个)
吉林大学学术科技奖 20-21-22-23年度
实习经历
科研助理,香港大学, 2023.06-Present
作为Research Assistant参与李嘉诚LKS医学院和生物医学系的暑研中,负责医学数据的整合整理和基于Neo4j的图数据库的scRNA-seq单细胞测序数据库与可视化软件的开发,整合和整理来自不同来源的大量医学数据
研究员,华大基因研究院,2023.06-2023.11
1.作为实习生参与华大基因研究院的生物信息研究算法研究,应用机器学习、统计学和计算生物学技术来处理和分析大规模基因组数据。
2.参与猛犸教育基金的运行和iGEM相关赛事的指导与管理,协助组织和协调教育活动和外联计划
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